More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0171 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  97.46 
 
 		 315 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  67.97 
 
 		 304 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  66.99 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  68.52 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  58.79 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  58.2 
 
 		 312 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  58.15 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  56.87 
 
 		 309 aa  351  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  62.42 
 
 		 311 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.09 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.09 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  54.09 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.88 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.87 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  48.37 
 
 		 350 aa  288  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  48.21 
 
 		 351 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  46.91 
 
 		 351 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  45.45 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  39.6 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  41.7 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  42.47 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  42.08 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.34 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  41.29 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.7 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.34 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.54 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  41.43 
 
 		 271 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  38.23 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  40.62 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  40.08 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  39.61 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.6 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  38.41 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.4 
 
 		 271 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  39.11 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  41.04 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.18 
 
 		 284 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  36.96 
 
 		 395 aa  158  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.03 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.19 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.25 
 
 		 395 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.55 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  36.8 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  35.25 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  34.36 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  35.63 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  35.63 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 395 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.84 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.43 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  34.35 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.27 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.94 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  33.21 
 
 		 396 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  33.21 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.21 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.98 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.86 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.48 
 
 		 454 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.89 
 
 		 272 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.59 
 
 		 379 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  34.36 
 
 		 403 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  34.1 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.1 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  34.1 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.36 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  33.58 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.25 
 
 		 390 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.7 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  33.58 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  33.58 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  33.58 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  33.58 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  33.58 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  33.58 
 
 		 396 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.98 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  33.58 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  35.11 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.91 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  35.32 
 
 		 1076 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  32.21 
 
 		 1074 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  32.65 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.09 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  36.5 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  34.36 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.5 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.21 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  31.21 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  31.72 
 
 		 442 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  35 
 
 		 378 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.92 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1054 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  38.5 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.29 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  32.17 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  30.8 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.12 
 
 		 1054 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  31.25 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>