271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1335 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  100 
 
 		 1017 aa  2081    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  42.11 
 
 		 1081 aa  798    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  44.62 
 
 		 1081 aa  883    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1054 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  51.66 
 
 		 1027 aa  1036    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  40.06 
 
 		 1041 aa  764    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  52.82 
 
 		 1031 aa  1057    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  44.37 
 
 		 1076 aa  912    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  46.22 
 
 		 1045 aa  941    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  54.09 
 
 		 1024 aa  1164    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  47.73 
 
 		 901 aa  677    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  44 
 
 		 1081 aa  872    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  44.09 
 
 		 899 aa  624  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.5 
 
 		 1054 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  33.94 
 
 		 1074 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  44.08 
 
 		 898 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  41.59 
 
 		 791 aa  543  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  38.6 
 
 		 889 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  41.85 
 
 		 873 aa  520  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  27.54 
 
 		 782 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  27.05 
 
 		 749 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  26.61 
 
 		 748 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  27.02 
 
 		 760 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  23.84 
 
 		 1211 aa  178  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  25.24 
 
 		 883 aa  156  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  33.1 
 
 		 283 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.3 
 
 		 283 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  27.13 
 
 		 605 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  26.79 
 
 		 605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  26.85 
 
 		 605 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  26.64 
 
 		 600 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  31.95 
 
 		 276 aa  136  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  24.69 
 
 		 651 aa  135  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  33.86 
 
 		 285 aa  134  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 		 278 aa  134  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  33.84 
 
 		 309 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  34.52 
 
 		 304 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  33.71 
 
 		 309 aa  133  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.12 
 
 		 318 aa  131  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  34.94 
 
 		 309 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  32.05 
 
 		 278 aa  129  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  34.21 
 
 		 304 aa  128  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  34.44 
 
 		 312 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  36.44 
 
 		 284 aa  125  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.23 
 
 		 328 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  35.07 
 
 		 325 aa  125  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  34.87 
 
 		 315 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.94 
 
 		 282 aa  124  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  33.92 
 
 		 315 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.54 
 
 		 283 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.06 
 
 		 323 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35 
 
 		 284 aa  122  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.39 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.47 
 
 		 272 aa  121  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  29.13 
 
 		 327 aa  121  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.69 
 
 		 283 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  32.93 
 
 		 284 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  22 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  33.6 
 
 		 282 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  35.22 
 
 		 284 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.16 
 
 		 282 aa  118  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  31.6 
 
 		 320 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.62 
 
 		 329 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 		 330 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  27.73 
 
 		 325 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.94 
 
 		 341 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.94 
 
 		 341 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.25 
 
 		 271 aa  115  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.21 
 
 		 282 aa  115  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.56 
 
 		 271 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.89 
 
 		 339 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.32 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  27.76 
 
 		 616 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.64 
 
 		 401 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  32.64 
 
 		 403 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  28.45 
 
 		 334 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  28.45 
 
 		 334 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  28.45 
 
 		 334 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.38 
 
 		 330 aa  110  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  32.13 
 
 		 381 aa  110  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.75 
 
 		 330 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  30.17 
 
 		 324 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  28.02 
 
 		 327 aa  108  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  29.71 
 
 		 271 aa  108  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.24 
 
 		 396 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.36 
 
 		 258 aa  108  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  31.12 
 
 		 391 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  32.24 
 
 		 396 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.86 
 
 		 310 aa  107  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  32.38 
 
 		 271 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  27.5 
 
 		 326 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  27.5 
 
 		 326 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  27.5 
 
 		 326 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.24 
 
 		 396 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  31.84 
 
 		 396 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.84 
 
 		 396 aa  106  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  32.24 
 
 		 407 aa  106  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  31.43 
 
 		 396 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.86 
 
 		 405 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  26.81 
 
 		 328 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>