More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2194 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  95.58 
 
 		 748 aa  1341    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  58.8 
 
 		 782 aa  830    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 749 aa  1479    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  93.89 
 
 		 760 aa  1300    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  28.48 
 
 		 791 aa  266  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  28.22 
 
 		 1045 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  30.51 
 
 		 898 aa  245  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  28.1 
 
 		 899 aa  244  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  28.1 
 
 		 1076 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  28.28 
 
 		 901 aa  232  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.78 
 
 		 1017 aa  232  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  28.85 
 
 		 1041 aa  231  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.37 
 
 		 1054 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.26 
 
 		 1081 aa  230  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.26 
 
 		 1081 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.37 
 
 		 1081 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  29.3 
 
 		 1031 aa  223  8e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  28.26 
 
 		 1027 aa  211  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.27 
 
 		 1024 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  27.41 
 
 		 889 aa  197  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  26.36 
 
 		 873 aa  196  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  25.46 
 
 		 1074 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  25.5 
 
 		 1211 aa  176  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1054 aa  173  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  26.55 
 
 		 605 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  26.55 
 
 		 605 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.02 
 
 		 283 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  30.38 
 
 		 616 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  32.88 
 
 		 282 aa  127  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.1 
 
 		 283 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.38 
 
 		 282 aa  126  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  30.74 
 
 		 651 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  33.89 
 
 		 284 aa  126  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  31.31 
 
 		 645 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.21 
 
 		 282 aa  124  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  27.03 
 
 		 600 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  33.68 
 
 		 284 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  32.29 
 
 		 605 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.59 
 
 		 282 aa  121  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  31.21 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  31.01 
 
 		 315 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  31.52 
 
 		 325 aa  118  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 278 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  35.69 
 
 		 283 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  34.98 
 
 		 284 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  31.37 
 
 		 309 aa  114  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  31.35 
 
 		 309 aa  114  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.77 
 
 		 328 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  33.06 
 
 		 285 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  29.96 
 
 		 309 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  33.2 
 
 		 312 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  32.41 
 
 		 304 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  31.1 
 
 		 318 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.5 
 
 		 283 aa  107  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  32.92 
 
 		 278 aa  105  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  31.1 
 
 		 304 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.4 
 
 		 271 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.22 
 
 		 271 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  34.07 
 
 		 271 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  30.89 
 
 		 311 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  33.21 
 
 		 276 aa  101  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.71 
 
 		 284 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 271 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  31.93 
 
 		 381 aa  99  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.89 
 
 		 272 aa  98.6  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.99 
 
 		 395 aa  98.2  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.19 
 
 		 395 aa  97.8  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  30.99 
 
 		 352 aa  97.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.19 
 
 		 395 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 		 271 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.19 
 
 		 395 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 		 407 aa  96.3  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  28.91 
 
 		 883 aa  96.3  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  35.14 
 
 		 255 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.27 
 
 		 401 aa  96.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1926  cytochrome c assembly protein  29.96 
 
 		 602 aa  95.9  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.457048  hitchhiker  0.00250068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.6 
 
 		 258 aa  95.5  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  32.27 
 
 		 403 aa  95.9  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  31.28 
 
 		 395 aa  95.1  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.08 
 
 		 405 aa  95.5  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 		 401 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  34.73 
 
 		 396 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  33.61 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.73 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  33.61 
 
 		 408 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.49 
 
 		 283 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.53 
 
 		 357 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  33.61 
 
 		 396 aa  93.2  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  31.12 
 
 		 381 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  34.73 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 		 396 aa  93.2  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  33.61 
 
 		 396 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.61 
 
 		 396 aa  92.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 		 396 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.04 
 
 		 340 aa  92  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  33.91 
 
 		 366 aa  91.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.73 
 
 		 396 aa  91.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>