More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2995 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 		 328 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  78.01 
 
 		 341 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  78.01 
 
 		 341 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  74.36 
 
 		 351 aa  511  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  77.25 
 
 		 349 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  72.57 
 
 		 350 aa  498  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  71.52 
 
 		 325 aa  477  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  68.95 
 
 		 351 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  53.31 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  51.88 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  53.52 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  51.19 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  54.07 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  50.35 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  50.17 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  50 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  48.78 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  50.35 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  49.29 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  40 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.04 
 
 		 282 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.01 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  40.88 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40.81 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  40.81 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  40.21 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  40.98 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.36 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  35.91 
 
 		 285 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  36.51 
 
 		 271 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.93 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40.6 
 
 		 271 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.47 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.2 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  39.18 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.78 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  38.66 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  37.55 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.59 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  35.62 
 
 		 278 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.43 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  34.76 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  34.45 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.95 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.83 
 
 		 283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  34.55 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  35.44 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.74 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.69 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  34.89 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.89 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  33.04 
 
 		 442 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  33.73 
 
 		 463 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  33.45 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.32 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.81 
 
 		 454 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.67 
 
 		 397 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  33.23 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  34.6 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  31.55 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1358  cytochrome c biogenesis protein  31.55 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0913399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1568  resC protein  31.55 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6021100000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  31.55 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1357  cytochrome c biogenesis protein  31.25 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1385  resC protein  31.55 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0185485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1496  resC protein  31.55 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3815  resC protein  31.55 
 
 		 385 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000474792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1530  resC protein  31.55 
 
 		 385 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1398  cytochrome c assembly protein  31.25 
 
 		 385 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.720843  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.58 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  36.43 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.37 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.42 
 
 		 405 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.96 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  34.45 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  34.45 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  34.45 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.51 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  32.41 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  31.82 
 
 		 473 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.4 
 
 		 258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.51 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  36.43 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  33.02 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  33.11 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  32.05 
 
 		 403 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.06 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  34.34 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  32.54 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.05 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  34 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.25 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.84 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  32.25 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  30.84 
 
 		 396 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  30.84 
 
 		 396 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>