216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2588 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  59.56 
 
 
651 aa  755    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
616 aa  1243    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  56.49 
 
 
645 aa  706    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  44.98 
 
 
605 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  44.98 
 
 
605 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  44.82 
 
 
605 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  47.1 
 
 
600 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  43 
 
 
1211 aa  450  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1926  cytochrome c assembly protein  32.64 
 
 
602 aa  253  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.457048  hitchhiker  0.00250068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  31.89 
 
 
883 aa  223  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  23.85 
 
 
1024 aa  130  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  30.38 
 
 
749 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  30.38 
 
 
748 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  30.38 
 
 
760 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  29.45 
 
 
1076 aa  125  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  30.27 
 
 
782 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  27.07 
 
 
791 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.99 
 
 
1081 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  23.55 
 
 
1045 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.99 
 
 
1081 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  26.71 
 
 
1074 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.99 
 
 
1081 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.88 
 
 
1054 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  24.59 
 
 
898 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  31.25 
 
 
304 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  27.34 
 
 
1054 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  22.43 
 
 
1017 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  27.84 
 
 
1031 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  30.4 
 
 
315 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  26.99 
 
 
1041 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  31.62 
 
 
889 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.14 
 
 
283 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  31.32 
 
 
304 aa  105  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  31.85 
 
 
278 aa  104  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  29.78 
 
 
315 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  27.65 
 
 
1027 aa  103  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.26 
 
 
276 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.63 
 
 
271 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.17 
 
 
271 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.77 
 
 
283 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  28.17 
 
 
899 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  30.42 
 
 
284 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.52 
 
 
283 aa  98.2  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  33.46 
 
 
284 aa  98.2  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  32.78 
 
 
283 aa  97.8  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  27.18 
 
 
901 aa  97.4  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.73 
 
 
282 aa  97.4  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  33.6 
 
 
282 aa  97.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.74 
 
 
283 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  32.28 
 
 
285 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.47 
 
 
282 aa  94  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.89 
 
 
272 aa  94  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.57 
 
 
258 aa  93.6  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 
282 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.69 
 
 
321 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  32.1 
 
 
284 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  28.15 
 
 
271 aa  91.3  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.67 
 
 
284 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  27.65 
 
 
318 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  29.64 
 
 
325 aa  89.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  31.32 
 
 
311 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  27.24 
 
 
271 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  30.26 
 
 
391 aa  88.6  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.03 
 
 
379 aa  87.4  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  29.55 
 
 
395 aa  87.4  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.09 
 
 
390 aa  87.4  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  32.95 
 
 
408 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  32.95 
 
 
396 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.32 
 
 
873 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  32.95 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  28.81 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.58 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.45 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  32.95 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  32.95 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  32.95 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  32.95 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  26.51 
 
 
309 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.31 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  28.45 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  32.31 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  27.38 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  32.95 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.31 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  28.68 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.08 
 
 
330 aa  84  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.73 
 
 
394 aa  84  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.92 
 
 
396 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  27.76 
 
 
309 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  32.74 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  31.92 
 
 
396 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  31.92 
 
 
396 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.93 
 
 
271 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.78 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.72 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.72 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.01 
 
 
405 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30 
 
 
454 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.57 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  27.44 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>