More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2348 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 
341 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 
341 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  78.01 
 
 
328 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  73.22 
 
 
351 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  71.79 
 
 
350 aa  504  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  70.09 
 
 
325 aa  484  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  72.43 
 
 
349 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  68.54 
 
 
351 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  49.09 
 
 
315 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  51.59 
 
 
304 aa  300  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  50.51 
 
 
315 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  49.39 
 
 
304 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  48.49 
 
 
295 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  50.53 
 
 
318 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  48.31 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  46.78 
 
 
309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  46.78 
 
 
309 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  46.78 
 
 
309 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  46.44 
 
 
312 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  39.48 
 
 
282 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  38.54 
 
 
284 aa  195  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.76 
 
 
283 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40.35 
 
 
283 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  40 
 
 
284 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.13 
 
 
282 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  37.17 
 
 
284 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  39.78 
 
 
271 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.93 
 
 
282 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  34.25 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  38.93 
 
 
271 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  39.29 
 
 
271 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.86 
 
 
271 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.73 
 
 
282 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.56 
 
 
271 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.9 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  36.95 
 
 
278 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.7 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  36.52 
 
 
276 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  35.74 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.77 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  36.65 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.29 
 
 
373 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  33.14 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  29.86 
 
 
391 aa  152  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  34.42 
 
 
395 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  29.13 
 
 
385 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.42 
 
 
454 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.39 
 
 
438 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  34.28 
 
 
444 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.65 
 
 
395 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.91 
 
 
283 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  32.65 
 
 
352 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  33.99 
 
 
444 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1357  cytochrome c biogenesis protein  29.38 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.61 
 
 
444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  29.38 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.04 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  29.38 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32 
 
 
446 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  31.62 
 
 
465 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1530  resC protein  29.08 
 
 
385 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1358  cytochrome c biogenesis protein  29.08 
 
 
385 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0913399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  30.45 
 
 
463 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  32.45 
 
 
329 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3815  resC protein  28.24 
 
 
385 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000474792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.97 
 
 
390 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  33.65 
 
 
473 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1398  cytochrome c assembly protein  29.08 
 
 
385 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.720843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1568  resC protein  28.78 
 
 
385 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6021100000000005e-28 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.56 
 
 
405 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  38.79 
 
 
396 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1385  resC protein  28.78 
 
 
385 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0185485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1496  resC protein  28.78 
 
 
385 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.11 
 
 
346 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.21 
 
 
397 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  37.85 
 
 
397 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2220  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.49 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  31.79 
 
 
378 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  32.9 
 
 
324 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  32.59 
 
 
328 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  32.9 
 
 
334 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  32.9 
 
 
334 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  32.9 
 
 
334 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  57.52 
 
 
472 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  32.26 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  33.11 
 
 
324 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.94 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.13 
 
 
351 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.35 
 
 
309 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.74 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  30.42 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.98 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.45 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.64 
 
 
401 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  31.34 
 
 
1076 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  32.64 
 
 
403 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  29.55 
 
 
268 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.64 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.88 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.79 
 
 
340 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>