More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0091 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 
454 aa  908    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.39 
 
 
390 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  50.99 
 
 
391 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  51.71 
 
 
379 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.45 
 
 
395 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  50.77 
 
 
395 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50 
 
 
395 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  50.33 
 
 
395 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  50.11 
 
 
396 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  50.11 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  50.11 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  50.11 
 
 
408 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  50.11 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  50.11 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  50.11 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  48.68 
 
 
396 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  46.14 
 
 
444 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  45.44 
 
 
463 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.14 
 
 
444 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.11 
 
 
394 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.02 
 
 
405 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  45.44 
 
 
465 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.56 
 
 
405 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  68.56 
 
 
381 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  47.58 
 
 
403 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.12 
 
 
438 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  46.25 
 
 
442 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  42.75 
 
 
473 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  67.42 
 
 
407 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  46.45 
 
 
444 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  62.54 
 
 
396 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  62.54 
 
 
396 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  62.54 
 
 
396 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  62.54 
 
 
396 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  62.54 
 
 
396 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  62.54 
 
 
396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  62.54 
 
 
396 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  62.19 
 
 
401 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  67.05 
 
 
401 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  53.59 
 
 
446 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.58 
 
 
395 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  56.58 
 
 
352 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  45.28 
 
 
284 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.42 
 
 
283 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.34 
 
 
282 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  44.44 
 
 
282 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.21 
 
 
282 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  42.21 
 
 
284 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  41.34 
 
 
284 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  42.97 
 
 
285 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40.43 
 
 
283 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.68 
 
 
282 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  39.15 
 
 
278 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  45.66 
 
 
276 aa  186  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  39.86 
 
 
283 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  42.2 
 
 
271 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  42.79 
 
 
271 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.74 
 
 
271 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.84 
 
 
271 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  39.64 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  40.83 
 
 
271 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.02 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39 
 
 
271 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.25 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.75 
 
 
283 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  36.36 
 
 
325 aa  160  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.17 
 
 
272 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  39.45 
 
 
283 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.05 
 
 
323 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  35.92 
 
 
329 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  36.08 
 
 
304 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.42 
 
 
341 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.42 
 
 
341 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.64 
 
 
309 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  38.84 
 
 
255 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.08 
 
 
373 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.81 
 
 
328 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.01 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  37.61 
 
 
320 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.94 
 
 
321 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.48 
 
 
315 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  34.48 
 
 
315 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.09 
 
 
339 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  36.02 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  38.82 
 
 
378 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  37.23 
 
 
396 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  37.66 
 
 
397 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.55 
 
 
346 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.39 
 
 
358 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  36.77 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.24 
 
 
321 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  35.29 
 
 
304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  32.69 
 
 
309 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.47 
 
 
258 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  34.44 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.09 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  31.79 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  35.27 
 
 
311 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.94 
 
 
301 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>