219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1926 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1926  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
602 aa  1216    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.457048  hitchhiker  0.00250068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  35.14 
 
 
600 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  33.68 
 
 
605 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  33.97 
 
 
605 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  33.68 
 
 
605 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  32.79 
 
 
616 aa  260  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  32.59 
 
 
645 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  33.11 
 
 
1211 aa  253  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  32.27 
 
 
651 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  27.69 
 
 
883 aa  149  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  27.57 
 
 
889 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  29.62 
 
 
1074 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  24 
 
 
1045 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  22.63 
 
 
1041 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.45 
 
 
1024 aa  105  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  26.84 
 
 
1054 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.75 
 
 
1054 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  27.34 
 
 
1027 aa  103  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  25.32 
 
 
1031 aa  101  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.2 
 
 
1081 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  23.96 
 
 
791 aa  100  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.84 
 
 
1081 aa  99.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.52 
 
 
1017 aa  99.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.14 
 
 
1081 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  27.44 
 
 
899 aa  97.4  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  30.16 
 
 
1076 aa  97.1  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  29.96 
 
 
749 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  27.55 
 
 
901 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  29.6 
 
 
748 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  29.6 
 
 
760 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  26.24 
 
 
898 aa  94  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  27.43 
 
 
873 aa  92.8  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  29.48 
 
 
278 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  31.84 
 
 
782 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  29.2 
 
 
304 aa  87  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.29 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  26.45 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.69 
 
 
284 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  25.4 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  28.4 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  31.36 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  24.76 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  27.97 
 
 
315 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  24.92 
 
 
312 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.41 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  29.2 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  27.59 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  29.25 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.52 
 
 
321 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  27.48 
 
 
318 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.57 
 
 
283 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.18 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.18 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  30.71 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  28.3 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  28.77 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.71 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.2 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  40.2 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.22 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.84 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.77 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  26.52 
 
 
408 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  28.83 
 
 
284 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  26.87 
 
 
325 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.98 
 
 
395 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  40.86 
 
 
351 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  29.86 
 
 
283 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.83 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  26.52 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.1 
 
 
272 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.87 
 
 
310 aa  72.8  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  26.52 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  26.52 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  26.52 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.22 
 
 
283 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  26.52 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  28.97 
 
 
396 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.75 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  29.88 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.3 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  26.52 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  28.74 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  28.95 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  29.71 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.27 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  28.3 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.2 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  28.64 
 
 
396 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.41 
 
 
282 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  32.87 
 
 
381 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  28.64 
 
 
396 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.64 
 
 
396 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  37.74 
 
 
295 aa  70.1  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  33.12 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.8 
 
 
309 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  28.38 
 
 
284 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  28.64 
 
 
396 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  33.12 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  28.64 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>