233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2821 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
651 aa  1316    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  59.56 
 
 
616 aa  745    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  57.69 
 
 
645 aa  727    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  45.01 
 
 
605 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  44.39 
 
 
605 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  44.24 
 
 
605 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  45.19 
 
 
600 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  41.76 
 
 
1211 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1926  cytochrome c assembly protein  32.27 
 
 
602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.457048  hitchhiker  0.00250068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 
883 aa  213  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.06 
 
 
1017 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  27.38 
 
 
1074 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  31.07 
 
 
760 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  31.07 
 
 
748 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  30.74 
 
 
749 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.39 
 
 
1024 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  25.56 
 
 
1045 aa  120  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  31.29 
 
 
782 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.4 
 
 
1054 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  22.83 
 
 
1041 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  26.37 
 
 
1027 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  29.82 
 
 
889 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  25.71 
 
 
1031 aa  115  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  28.48 
 
 
1081 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  31.15 
 
 
1076 aa  115  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.83 
 
 
1081 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.83 
 
 
1081 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 
898 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  28.15 
 
 
791 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  30.42 
 
 
1054 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  28.68 
 
 
901 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.26 
 
 
271 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.26 
 
 
271 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  28.4 
 
 
304 aa  100  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  30.29 
 
 
271 aa  97.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  29.3 
 
 
315 aa  97.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.15 
 
 
276 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  27.21 
 
 
899 aa  95.9  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  28.74 
 
 
315 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  35.25 
 
 
283 aa  95.1  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.12 
 
 
283 aa  94.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.39 
 
 
283 aa  92  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  29.95 
 
 
278 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  33.74 
 
 
284 aa  90.9  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  27.55 
 
 
304 aa  90.9  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.74 
 
 
283 aa  90.5  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  29.46 
 
 
873 aa  89.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  31.25 
 
 
271 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.41 
 
 
282 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  30.83 
 
 
311 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.06 
 
 
258 aa  88.6  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.02 
 
 
271 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.51 
 
 
282 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  31.92 
 
 
285 aa  87.4  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  32.51 
 
 
284 aa  87.4  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  29.41 
 
 
278 aa  87  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  33.2 
 
 
282 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  32.29 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.66 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.66 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  29.14 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  27.52 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  27.31 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  27.12 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.57 
 
 
272 aa  84  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.29 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.7 
 
 
405 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.47 
 
 
271 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 
330 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 
324 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.96 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.88 
 
 
321 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  34.84 
 
 
324 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.46 
 
 
390 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  29.55 
 
 
395 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  33.12 
 
 
327 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.03 
 
 
282 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.88 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  25.82 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.12 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  26.64 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.16 
 
 
396 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  31.16 
 
 
396 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  33.11 
 
 
391 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.33 
 
 
454 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.68 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  31.16 
 
 
396 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.16 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  30.28 
 
 
401 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  31.94 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  27.46 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  31.94 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  30.22 
 
 
381 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.19 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  30.45 
 
 
407 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.84 
 
 
333 aa  79  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  35.22 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>