241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0197 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  100 
 
 
1027 aa  2096    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  47.36 
 
 
1081 aa  954    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  78.29 
 
 
1031 aa  1635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  38.69 
 
 
1054 aa  676    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  51.66 
 
 
1017 aa  1045    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  40.62 
 
 
1041 aa  790    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  46.71 
 
 
1081 aa  943    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  47.73 
 
 
1076 aa  967    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  59.12 
 
 
1024 aa  1249    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  46.1 
 
 
899 aa  642    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  50.34 
 
 
901 aa  724    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  47.17 
 
 
1081 aa  954    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  51.2 
 
 
1045 aa  1049    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  35.04 
 
 
1074 aa  589  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  44.67 
 
 
791 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.11 
 
 
1054 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  44.18 
 
 
898 aa  568  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  42.05 
 
 
889 aa  535  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  43.02 
 
 
873 aa  515  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  29.52 
 
 
782 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  28.99 
 
 
748 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  28.3 
 
 
749 aa  211  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  28.01 
 
 
760 aa  201  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  24.46 
 
 
1211 aa  147  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.04 
 
 
283 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  34.84 
 
 
283 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  31.63 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  37.5 
 
 
278 aa  127  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  33.33 
 
 
304 aa  127  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  33.33 
 
 
318 aa  126  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  34.41 
 
 
284 aa  125  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  32.99 
 
 
309 aa  125  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  32.48 
 
 
278 aa  124  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36 
 
 
282 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  32.99 
 
 
309 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  34.12 
 
 
304 aa  122  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  25.19 
 
 
605 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.44 
 
 
283 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  25.51 
 
 
605 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  25.51 
 
 
605 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.51 
 
 
283 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 
284 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  33.82 
 
 
312 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.2 
 
 
323 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  31.56 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  32.81 
 
 
327 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  32 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.64 
 
 
339 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  33.59 
 
 
315 aa  118  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  33.59 
 
 
315 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  32.33 
 
 
309 aa  117  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  34.94 
 
 
311 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  28.11 
 
 
645 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 
276 aa  115  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  32.71 
 
 
282 aa  115  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  24.78 
 
 
600 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  25.85 
 
 
651 aa  115  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.58 
 
 
282 aa  115  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  32.22 
 
 
330 aa  114  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 
325 aa  114  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.83 
 
 
271 aa  114  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  30.22 
 
 
325 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.53 
 
 
395 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.58 
 
 
284 aa  112  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  28.74 
 
 
334 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  28.74 
 
 
334 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  28.74 
 
 
334 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  31.86 
 
 
351 aa  111  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  30.53 
 
 
352 aa  111  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  30.47 
 
 
324 aa  111  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.35 
 
 
328 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.06 
 
 
401 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  35.27 
 
 
396 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.71 
 
 
282 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  28.03 
 
 
616 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  33.06 
 
 
403 aa  109  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  30.94 
 
 
395 aa  109  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.33 
 
 
321 aa  109  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.85 
 
 
396 aa  108  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.73 
 
 
396 aa  108  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  32.79 
 
 
381 aa  108  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  34.85 
 
 
396 aa  108  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  34.44 
 
 
396 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.44 
 
 
396 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 
407 aa  108  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.89 
 
 
361 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.27 
 
 
394 aa  107  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  30.51 
 
 
328 aa  107  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  34.02 
 
 
396 aa  106  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 
390 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  33.2 
 
 
401 aa  105  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.61 
 
 
405 aa  105  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.95 
 
 
395 aa  105  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  31.2 
 
 
271 aa  105  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.83 
 
 
350 aa  105  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.92 
 
 
258 aa  104  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.95 
 
 
395 aa  104  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.95 
 
 
395 aa  104  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.43 
 
 
271 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.15 
 
 
271 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>