33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4405 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  788    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.22864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2587  hypothetical protein  53.14 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2822  hypothetical protein  56.45 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1852  hypothetical protein  45.99 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1772  hypothetical protein  46.58 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2104  hypothetical protein  45.72 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1712  hypothetical protein  42.86 
 
 		 386 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  32.29 
 
 		 1211 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.51 
 
 		 1017 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  30.17 
 
 		 1041 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.91 
 
 		 1081 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  21.88 
 
 		 899 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 1081 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.91 
 
 		 1081 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  24.83 
 
 		 898 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  23.62 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  38.89 
 
 		 883 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  33.7 
 
 		 1076 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1927  hypothetical protein  32.77 
 
 		 265 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595624  normal  0.0101264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  30.61 
 
 		 1045 aa  53.9  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  27.78 
 
 		 1031 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  27.41 
 
 		 782 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  31.52 
 
 		 791 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  26.56 
 
 		 748 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  26.56 
 
 		 760 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  26.56 
 
 		 749 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  29.63 
 
 		 1027 aa  49.7  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  28.87 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.93 
 
 		 1054 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  28.87 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  19.86 
 
 		 873 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  27.56 
 
 		 1074 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.84 
 
 		 1024 aa  44.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>