34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2822 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2822  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  796    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2587  hypothetical protein  62.86 
 
 
387 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4405  hypothetical protein  56.45 
 
 
391 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.22864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1772  hypothetical protein  45.04 
 
 
392 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2104  hypothetical protein  44.56 
 
 
392 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1852  hypothetical protein  44.56 
 
 
392 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1712  hypothetical protein  44.56 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230634  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  33.72 
 
 
1211 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  22.22 
 
 
899 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.06 
 
 
1017 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1927  hypothetical protein  35.79 
 
 
265 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595624  normal  0.0101264 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  31.53 
 
 
901 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  37.07 
 
 
883 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.82 
 
 
1081 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.82 
 
 
1081 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.29 
 
 
1081 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  22.39 
 
 
898 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  30.69 
 
 
782 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  22.7 
 
 
1031 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  21.75 
 
 
873 aa  52.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  27.17 
 
 
791 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  28.87 
 
 
749 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  23.77 
 
 
1041 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  27.08 
 
 
1045 aa  49.7  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.27 
 
 
1054 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  23.87 
 
 
1076 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.67 
 
 
1024 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  29.31 
 
 
456 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  28 
 
 
1054 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  26.8 
 
 
760 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  26.8 
 
 
748 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  27.94 
 
 
1074 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  36 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  24.46 
 
 
1027 aa  43.5  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>