69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1852 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  800    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1772  hypothetical protein  98.72 
 
 		 392 aa  788    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2104  hypothetical protein  99.49 
 
 		 392 aa  796    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1712  hypothetical protein  70.51 
 
 		 386 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2587  hypothetical protein  47.52 
 
 		 387 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4405  hypothetical protein  45.83 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.22864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2822  hypothetical protein  44.59 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  33.82 
 
 		 1211 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  37.9 
 
 		 883 aa  81.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 1017 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  35.42 
 
 		 1081 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  35.42 
 
 		 1081 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  35.42 
 
 		 1081 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  34.58 
 
 		 1031 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  23.9 
 
 		 899 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1927  hypothetical protein  36.19 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595624  normal  0.0101264 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  28.1 
 
 		 1076 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  29.57 
 
 		 782 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 		 1045 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  34.58 
 
 		 1027 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  33.64 
 
 		 901 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  34.31 
 
 		 749 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  26.97 
 
 		 1041 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  22.04 
 
 		 898 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  23.86 
 
 		 889 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.37 
 
 		 1054 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 748 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  19.81 
 
 		 873 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  32.11 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.69 
 
 		 1024 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  44.74 
 
 		 733 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1054 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  33.02 
 
 		 1074 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  42.11 
 
 		 750 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  40.91 
 
 		 670 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  33.33 
 
 		 701 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  38.36 
 
 		 732 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  38.89 
 
 		 664 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  36.59 
 
 		 722 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  36.84 
 
 		 734 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  32.88 
 
 		 742 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  40.91 
 
 		 660 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  36.99 
 
 		 727 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  34.85 
 
 		 679 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  37.88 
 
 		 734 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  36.36 
 
 		 700 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  29.23 
 
 		 461 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  29.23 
 
 		 461 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  31.37 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  34.85 
 
 		 717 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  34.85 
 
 		 724 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  34.85 
 
 		 717 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  36.36 
 
 		 741 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  31.51 
 
 		 739 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  29.2 
 
 		 694 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  36.36 
 
 		 700 aa  43.9  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  34.33 
 
 		 718 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  34.33 
 
 		 718 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  34.33 
 
 		 725 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  34.33 
 
 		 718 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  34.33 
 
 		 725 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  34.33 
 
 		 718 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  34.33 
 
 		 719 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  34.21 
 
 		 740 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  34.21 
 
 		 737 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  34.18 
 
 		 614 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  34.18 
 
 		 614 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  27.36 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>