131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3713 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  61.06 
 
 
700 aa  786    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  48.88 
 
 
722 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  59.64 
 
 
733 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  99.86 
 
 
718 aa  1464    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  85.02 
 
 
738 aa  1239    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  95.55 
 
 
719 aa  1385    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  48.84 
 
 
739 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  75.11 
 
 
740 aa  1119    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  60.19 
 
 
750 aa  852    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  86.16 
 
 
737 aa  1264    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  84.88 
 
 
740 aa  1251    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  86.16 
 
 
737 aa  1264    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  51.34 
 
 
717 aa  677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  50.97 
 
 
732 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  48.16 
 
 
742 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  50.92 
 
 
717 aa  673    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  99.72 
 
 
718 aa  1461    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  49.57 
 
 
724 aa  670    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  48.68 
 
 
679 aa  656    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  99.72 
 
 
718 aa  1461    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  100 
 
 
725 aa  1478    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  99.86 
 
 
718 aa  1464    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  99.86 
 
 
725 aa  1475    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  48.75 
 
 
727 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  85.88 
 
 
738 aa  1234    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  85.88 
 
 
737 aa  1261    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  84.88 
 
 
738 aa  1253    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  75.81 
 
 
741 aa  1119    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  73.17 
 
 
737 aa  1123    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  60.45 
 
 
734 aa  837    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  60.31 
 
 
734 aa  837    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  44.22 
 
 
694 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  42.5 
 
 
670 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  42.17 
 
 
660 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  34.57 
 
 
679 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  32.95 
 
 
678 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  33.72 
 
 
700 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  33.9 
 
 
701 aa  361  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  31.31 
 
 
664 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  35.56 
 
 
614 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  35.56 
 
 
614 aa  280  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  27.07 
 
 
454 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  28.43 
 
 
452 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  28.76 
 
 
453 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  26.32 
 
 
454 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  27.15 
 
 
452 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  25.08 
 
 
455 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  23.92 
 
 
457 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  28.85 
 
 
452 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  22.63 
 
 
535 aa  97.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  26.79 
 
 
461 aa  95.9  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  27.37 
 
 
423 aa  95.1  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  22.25 
 
 
457 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  25.33 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.92 
 
 
426 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.44 
 
 
458 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  24.31 
 
 
511 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.7 
 
 
459 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.37 
 
 
426 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  22.81 
 
 
457 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.46 
 
 
429 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.36 
 
 
428 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  23.79 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  20.55 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  20.66 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.74 
 
 
428 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  24.29 
 
 
522 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  20.63 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  27.12 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  23.14 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.26 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  20.25 
 
 
428 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  22.66 
 
 
472 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  27.78 
 
 
545 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  21.54 
 
 
553 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.95 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  26.93 
 
 
588 aa  67.8  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  21.25 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  24.02 
 
 
540 aa  66.6  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  21.86 
 
 
434 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  26.11 
 
 
448 aa  64.3  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  28.97 
 
 
576 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  26.1 
 
 
569 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  22.86 
 
 
456 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  27.1 
 
 
550 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  27.1 
 
 
550 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  27.1 
 
 
550 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  26.79 
 
 
536 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  26.79 
 
 
536 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  26.79 
 
 
536 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.91 
 
 
548 aa  60.1  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  26.67 
 
 
558 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  28.24 
 
 
336 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  23.98 
 
 
395 aa  58.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  22.6 
 
 
484 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  19.94 
 
 
542 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  29.63 
 
 
1045 aa  57.4  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.59 
 
 
578 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  29.78 
 
 
532 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  25 
 
 
529 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>