21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1807 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  821    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  66.67 
 
 
412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  57.32 
 
 
418 aa  472  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  54.82 
 
 
410 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  50.86 
 
 
422 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  52.26 
 
 
411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  50.25 
 
 
408 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  44.5 
 
 
411 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  28.98 
 
 
404 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  29.18 
 
 
238 aa  93.6  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  34.15 
 
 
544 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  34.15 
 
 
542 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  34.15 
 
 
557 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  25.45 
 
 
782 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.07 
 
 
873 aa  47  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  46.67 
 
 
727 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  45.24 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  43.64 
 
 
724 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.55 
 
 
1081 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.55 
 
 
1081 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.55 
 
 
1081 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>