140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0186 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  100 
 
 		 670 aa  1376    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  51.46 
 
 		 660 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  45.85 
 
 		 734 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  45.82 
 
 		 750 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  45.71 
 
 		 734 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  46.92 
 
 		 733 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  47 
 
 		 694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  46.44 
 
 		 700 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  42.59 
 
 		 741 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  43.8 
 
 		 679 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  42.88 
 
 		 740 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  42.31 
 
 		 737 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  42.31 
 
 		 737 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  42.2 
 
 		 737 aa  555  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  42.17 
 
 		 737 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  42.19 
 
 		 738 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  42.92 
 
 		 738 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  41.76 
 
 		 740 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  41.59 
 
 		 738 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  42.5 
 
 		 718 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  42.5 
 
 		 718 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  42.5 
 
 		 718 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  42.5 
 
 		 725 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  42.5 
 
 		 718 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  42.5 
 
 		 725 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  41.72 
 
 		 719 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  43.85 
 
 		 739 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  43.77 
 
 		 724 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  43.8 
 
 		 717 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  43.65 
 
 		 717 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  42.94 
 
 		 732 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  42.98 
 
 		 727 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  41.28 
 
 		 742 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  41.52 
 
 		 679 aa  505  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  41.53 
 
 		 722 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  38.66 
 
 		 678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  36.87 
 
 		 700 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  38.46 
 
 		 701 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  38.28 
 
 		 664 aa  452  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  36.67 
 
 		 614 aa  297  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  36.67 
 
 		 614 aa  297  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  26.07 
 
 		 457 aa  105  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  27.81 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  26.95 
 
 		 454 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  27.01 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  25.72 
 
 		 452 aa  97.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  26.2 
 
 		 535 aa  96.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  26.17 
 
 		 454 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  27.27 
 
 		 423 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  27.01 
 
 		 452 aa  90.5  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.64 
 
 		 426 aa  89.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  24.18 
 
 		 461 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  24.18 
 
 		 461 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.24 
 
 		 429 aa  88.6  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.58 
 
 		 457 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.16 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  25.31 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  26.11 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  23.79 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.19 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  24.84 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  25.33 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  24.49 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  27.39 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.53 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  25.28 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  26.3 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  25.49 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  22.1 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  24.32 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  22.81 
 
 		 553 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  22.19 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  21.96 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  26.11 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.32 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  23.51 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  24.44 
 
 		 457 aa  72  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.32 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  22.79 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  21.25 
 
 		 541 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  26.1 
 
 		 558 aa  70.5  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  46.03 
 
 		 336 aa  70.1  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  21.63 
 
 		 434 aa  70.5  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  26.63 
 
 		 448 aa  70.5  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  21.25 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  28.45 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  21.45 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.15 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.15 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  21.25 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  21.25 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  21.25 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  21.45 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  25.23 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  21.18 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  25.88 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.93 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.13 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  20.31 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  24.59 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>