24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0342 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 742 aa  1510    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1123 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  25.14 
 
 		 425 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.56 
 
 		 833 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  25.5 
 
 		 876 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  24.37 
 
 		 400 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.61 
 
 		 792 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  25.3 
 
 		 841 aa  89.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.06 
 
 		 830 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  26.63 
 
 		 832 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25.66 
 
 		 832 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  25.21 
 
 		 728 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  25.65 
 
 		 737 aa  79  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.65 
 
 		 765 aa  78.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  26.35 
 
 		 991 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  24.09 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.75 
 
 		 719 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  21.82 
 
 		 751 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  25 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  24.18 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1276 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1187 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3017  hypothetical protein  31.15 
 
 		 828 aa  49.7  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  25.26 
 
 		 205 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>