More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0979 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  100 
 
 
315 aa  640    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  73.63 
 
 
296 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  73.04 
 
 
296 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  76.03 
 
 
297 aa  427  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  45.03 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  38.87 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1668  hypothetical protein  34.98 
 
 
323 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.788858  hitchhiker  0.00000000000826501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1474  ROK family protein  35.16 
 
 
324 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  35.08 
 
 
308 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2511  ROK family protein  34.41 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0043  ROK family protein  33.98 
 
 
326 aa  146  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0272588 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3840  ROK family protein  31 
 
 
339 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  34.94 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2511  ROK family protein  34.19 
 
 
325 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3069  ROK family protein  32.58 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  33.67 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.94 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.94 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.27 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.97 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.81 
 
 
322 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  31.6 
 
 
313 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  28.85 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.79 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.82 
 
 
391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  32.87 
 
 
292 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.67 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.01 
 
 
352 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  30.06 
 
 
321 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  31.82 
 
 
266 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.2 
 
 
305 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  33.85 
 
 
361 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.17 
 
 
315 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  33.06 
 
 
290 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  33.06 
 
 
290 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  33.06 
 
 
290 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.5 
 
 
318 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.5 
 
 
347 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.01 
 
 
300 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  26.58 
 
 
313 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  29.25 
 
 
321 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.65 
 
 
312 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  29.72 
 
 
307 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  33.59 
 
 
313 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  31.51 
 
 
292 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  28.84 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  30.16 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  28.53 
 
 
335 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  30.9 
 
 
357 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.75 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  30.18 
 
 
336 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  33.59 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.51 
 
 
385 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  31.27 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  31.27 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.36 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  31.75 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  30.04 
 
 
478 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  29.81 
 
 
323 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  28.03 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.39 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.97 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  30.38 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  28.03 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  28.2 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  28.57 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.55 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.16 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  26.23 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.16 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  29.37 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  36.99 
 
 
291 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  35.51 
 
 
291 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  35.51 
 
 
291 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  35.51 
 
 
291 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  30.63 
 
 
340 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  35.92 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  35.51 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  29.24 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  27.44 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  35.51 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  27.76 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  28.88 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  29.7 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  28.57 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  34.69 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  28.12 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.63 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  31.21 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  27.62 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  35.1 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  27.76 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  29.64 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  27.41 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.64 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  26.71 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
304 aa  89  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2058  ROK family protein  28.22 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.64 
 
 
303 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>