More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1684 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  52.47 
 
 		 2704 aa  1697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  60.45 
 
 		 2771 aa  3222    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  51.05 
 
 		 2531 aa  1507    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  41.89 
 
 		 2189 aa  712    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  51.8 
 
 		 2694 aa  1702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  46.33 
 
 		 1764 aa  1173    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  45.61 
 
 		 1272 aa  1097    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  48.33 
 
 		 1772 aa  1057    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.55 
 
 		 1845 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  43.62 
 
 		 2560 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  38.96 
 
 		 2260 aa  925    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  50.67 
 
 		 2664 aa  1669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  46.81 
 
 		 2448 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  51.21 
 
 		 2657 aa  1619    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  51.54 
 
 		 2640 aa  1588    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  45.51 
 
 		 2620 aa  2119    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  42.94 
 
 		 2338 aa  770    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  46.08 
 
 		 2764 aa  2194    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  52.34 
 
 		 2624 aa  1609    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  43.36 
 
 		 2642 aa  898    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  43.43 
 
 		 2266 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  46.98 
 
 		 2750 aa  2218    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  48.12 
 
 		 2542 aa  1456    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  43.76 
 
 		 2298 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  100 
 
 		 2661 aa  5438    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.95 
 
 		 2249 aa  715    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  45.71 
 
 		 2300 aa  1253    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  52.32 
 
 		 2693 aa  1714    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.36 
 
 		 2443 aa  747    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  51.67 
 
 		 2703 aa  1702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  51.32 
 
 		 2619 aa  1641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.45 
 
 		 2414 aa  674    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  54.57 
 
 		 2683 aa  1095    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.13 
 
 		 2477 aa  758    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  40.04 
 
 		 2674 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  39.02 
 
 		 2503 aa  601  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  39.14 
 
 		 2553 aa  583  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  35.47 
 
 		 2327 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  36.49 
 
 		 2314 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.41 
 
 		 2628 aa  515  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  34.55 
 
 		 3008 aa  511  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  36.41 
 
 		 3243 aa  507  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  35.98 
 
 		 2386 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.88 
 
 		 2772 aa  503  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 		 2816 aa  483  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  34.8 
 
 		 1631 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4749  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 584 aa  442  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.792505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  30.78 
 
 		 2754 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2591  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.48 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  30.63 
 
 		 1740 aa  388  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3916  KR domain-containing protein  36.38 
 
 		 576 aa  386  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.05 
 
 		 3099 aa  377  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  32.17 
 
 		 1453 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  32.82 
 
 		 2888 aa  371  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 		 3115 aa  367  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  29.44 
 
 		 2462 aa  367  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  30.63 
 
 		 2614 aa  359  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.06 
 
 		 1372 aa  359  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  30.72 
 
 		 1646 aa  358  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.96 
 
 		 1349 aa  355  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  31 
 
 		 1349 aa  354  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.62 
 
 		 2551 aa  353  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  30.27 
 
 		 1929 aa  351  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  30.24 
 
 		 1935 aa  349  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  29.33 
 
 		 3702 aa  348  7e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.77 
 
 		 1337 aa  348  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  29.26 
 
 		 3693 aa  345  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  29.26 
 
 		 3693 aa  345  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 1587 aa  344  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.31 
 
 		 4478 aa  342  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 1874 aa  337  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  30.27 
 
 		 1535 aa  337  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  29.95 
 
 		 1548 aa  335  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.21 
 
 		 1909 aa  334  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  30.34 
 
 		 4151 aa  334  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  29.38 
 
 		 7210 aa  333  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  29.03 
 
 		 4080 aa  334  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.66 
 
 		 1354 aa  333  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 		 1656 aa  333  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  31.22 
 
 		 1470 aa  333  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  29.62 
 
 		 3679 aa  332  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  30.48 
 
 		 1934 aa  332  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  30.78 
 
 		 1908 aa  332  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 		 2551 aa  331  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  28.25 
 
 		 1087 aa  331  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  29.84 
 
 		 1985 aa  330  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  31.21 
 
 		 2273 aa  330  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  28.94 
 
 		 3176 aa  330  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  29.43 
 
 		 3676 aa  329  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  29.8 
 
 		 1574 aa  327  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  39.67 
 
 		 1733 aa  325  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  29.17 
 
 		 1923 aa  325  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  29.57 
 
 		 1488 aa  325  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  30.57 
 
 		 1520 aa  323  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.94 
 
 		 1101 aa  322  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 2376 aa  322  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.03 
 
 		 1816 aa  322  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  31.05 
 
 		 1795 aa  321  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  28.85 
 
 		 1144 aa  320  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  30.66 
 
 		 2176 aa  320  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>