61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2219 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2219  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 487 aa  1003    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  0.586919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  23.26 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  25.17 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  22.8 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  26.63 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  29.05 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  23.36 
 
 		 318 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  30.41 
 
 		 142 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  29.17 
 
 		 157 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.37 
 
 		 558 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  30.63 
 
 		 202 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  31.37 
 
 		 186 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  24.05 
 
 		 187 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  23.57 
 
 		 187 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  27.46 
 
 		 162 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  27.27 
 
 		 178 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  29.56 
 
 		 183 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  30.26 
 
 		 187 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  28.08 
 
 		 161 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  29.37 
 
 		 163 aa  51.2  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  29.37 
 
 		 163 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  26.53 
 
 		 160 aa  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  27.81 
 
 		 184 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  27.22 
 
 		 183 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  29.22 
 
 		 194 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  28.67 
 
 		 184 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  28.17 
 
 		 191 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  26.11 
 
 		 166 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  26.57 
 
 		 163 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  27.78 
 
 		 193 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  27.15 
 
 		 195 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  20.81 
 
 		 315 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  33.93 
 
 		 142 aa  47.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  28.1 
 
 		 192 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  28.87 
 
 		 231 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  24.84 
 
 		 202 aa  47  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  24.27 
 
 		 611 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  29.31 
 
 		 157 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  26.24 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  25.17 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  30.5 
 
 		 185 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  25.87 
 
 		 208 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  26.87 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  25.52 
 
 		 184 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  25.42 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  26 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  27.97 
 
 		 156 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  21.07 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  25.95 
 
 		 184 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  29.91 
 
 		 160 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  30.51 
 
 		 168 aa  44.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  24.83 
 
 		 141 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  22.77 
 
 		 194 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  22.77 
 
 		 194 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  25.39 
 
 		 187 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.89 
 
 		 141 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  25.83 
 
 		 184 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  26.76 
 
 		 167 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  27.12 
 
 		 156 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  27.48 
 
 		 194 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  25 
 
 		 191 aa  43.1  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>