More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1474 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  48.98 
 
 		 810 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  65.82 
 
 		 750 aa  1018    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  50.19 
 
 		 797 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  46.01 
 
 		 752 aa  707    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  51.99 
 
 		 805 aa  808    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  50.32 
 
 		 794 aa  794    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  46.73 
 
 		 798 aa  727    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 752 aa  700    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  53.82 
 
 		 761 aa  803    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  51.21 
 
 		 754 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  55.16 
 
 		 753 aa  875    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  52.27 
 
 		 752 aa  769    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  60.59 
 
 		 745 aa  952    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  51.15 
 
 		 826 aa  768    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  61.68 
 
 		 745 aa  953    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  57.73 
 
 		 752 aa  894    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  50.58 
 
 		 795 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  51.8 
 
 		 796 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  49.55 
 
 		 797 aa  771    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  71.37 
 
 		 751 aa  1118    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  51.55 
 
 		 795 aa  769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  50.45 
 
 		 793 aa  763    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  51.29 
 
 		 790 aa  783    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 799 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 788 aa  765    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  55.25 
 
 		 754 aa  865    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  49.94 
 
 		 799 aa  767    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  50.83 
 
 		 797 aa  774    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  54.41 
 
 		 761 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  100 
 
 		 758 aa  1563    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 798 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  48.07 
 
 		 760 aa  743    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 792 aa  812    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  48.53 
 
 		 750 aa  713    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  49.55 
 
 		 798 aa  783    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  53.4 
 
 		 768 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  51.29 
 
 		 794 aa  800    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  50.83 
 
 		 790 aa  814    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  51.15 
 
 		 792 aa  796    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 756 aa  823    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  49.81 
 
 		 801 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  50.9 
 
 		 795 aa  794    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  51.03 
 
 		 827 aa  776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  50.45 
 
 		 793 aa  763    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  51.46 
 
 		 792 aa  794    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  50.7 
 
 		 795 aa  793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  52.13 
 
 		 790 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  50.13 
 
 		 796 aa  796    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  50.45 
 
 		 793 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 780 aa  919    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 790 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  37.38 
 
 		 850 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  35.87 
 
 		 838 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  36.52 
 
 		 838 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  35.69 
 
 		 877 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.28 
 
 		 838 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  36.87 
 
 		 823 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  37.91 
 
 		 844 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  36.31 
 
 		 843 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  42.25 
 
 		 947 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  37.59 
 
 		 853 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  41.36 
 
 		 954 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  41.5 
 
 		 955 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  37.53 
 
 		 832 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  42.35 
 
 		 937 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  42.64 
 
 		 947 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  42.79 
 
 		 947 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  36.47 
 
 		 838 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  41.27 
 
 		 958 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  41.27 
 
 		 958 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  41.14 
 
 		 958 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  41.27 
 
 		 958 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  41.27 
 
 		 958 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  37.08 
 
 		 861 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  41.3 
 
 		 957 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  41.14 
 
 		 958 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  41.14 
 
 		 958 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  41.74 
 
 		 945 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  41.27 
 
 		 958 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  41.46 
 
 		 962 aa  502  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  41.14 
 
 		 958 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  41.84 
 
 		 941 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  41 
 
 		 959 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  41.46 
 
 		 937 aa  498  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  41.41 
 
 		 956 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  42.5 
 
 		 952 aa  496  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  41.57 
 
 		 968 aa  494  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  35.42 
 
 		 820 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  41.34 
 
 		 942 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  42.67 
 
 		 952 aa  495  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  37.2 
 
 		 860 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  42.07 
 
 		 961 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  34.21 
 
 		 950 aa  492  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  42.46 
 
 		 937 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.22 
 
 		 827 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  42.84 
 
 		 916 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  36.11 
 
 		 848 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  43.13 
 
 		 916 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  36.9 
 
 		 863 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  36.23 
 
 		 848 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>