More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0152 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1251    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  63.53 
 
 		 607 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  51.37 
 
 		 613 aa  631  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  46.61 
 
 		 610 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  47.63 
 
 		 611 aa  571  1e-161  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  45.48 
 
 		 612 aa  567  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  43.7 
 
 		 608 aa  522  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 		 616 aa  497  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  42.33 
 
 		 609 aa  485  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  39.42 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.39 
 
 		 580 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  41.79 
 
 		 582 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.7 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  35.99 
 
 		 647 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.75 
 
 		 580 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  40.04 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  37.4 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  38.92 
 
 		 649 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  36.6 
 
 		 634 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 		 634 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.81 
 
 		 611 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  35.89 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.64 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.61 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  38.92 
 
 		 639 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  39.92 
 
 		 589 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.72 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.66 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.55 
 
 		 611 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.63 
 
 		 596 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.44 
 
 		 579 aa  352  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.31 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.67 
 
 		 586 aa  349  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.52 
 
 		 597 aa  349  9e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  36.86 
 
 		 586 aa  349  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  37.16 
 
 		 627 aa  347  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.67 
 
 		 586 aa  346  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.67 
 
 		 586 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.47 
 
 		 586 aa  345  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.67 
 
 		 586 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.47 
 
 		 586 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.27 
 
 		 586 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.27 
 
 		 586 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.67 
 
 		 586 aa  343  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  36.27 
 
 		 586 aa  342  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.1 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  35.06 
 
 		 550 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  38.07 
 
 		 578 aa  341  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.64 
 
 		 575 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.51 
 
 		 587 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  41.62 
 
 		 597 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  38.2 
 
 		 580 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.49 
 
 		 584 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  38.2 
 
 		 580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  37.14 
 
 		 578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 585 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  34.81 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.68 
 
 		 602 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.38 
 
 		 600 aa  334  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  40.79 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.03 
 
 		 578 aa  332  9e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  40.04 
 
 		 598 aa  332  9e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  38.45 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.14 
 
 		 596 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.95 
 
 		 613 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.94 
 
 		 578 aa  331  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.36 
 
 		 597 aa  331  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.01 
 
 		 600 aa  331  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.94 
 
 		 578 aa  331  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.36 
 
 		 597 aa  330  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  35.29 
 
 		 586 aa  330  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  35.19 
 
 		 600 aa  330  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.48 
 
 		 583 aa  330  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.29 
 
 		 601 aa  329  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.42 
 
 		 590 aa  329  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  35.37 
 
 		 582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 636 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.77 
 
 		 608 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.07 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.92 
 
 		 601 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.73 
 
 		 602 aa  327  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  35.4 
 
 		 601 aa  327  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  36.05 
 
 		 579 aa  327  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.21 
 
 		 618 aa  326  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.06 
 
 		 601 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.06 
 
 		 601 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.09 
 
 		 614 aa  326  9e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.62 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  37.32 
 
 		 594 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  36.25 
 
 		 613 aa  325  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  36.84 
 
 		 596 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.1 
 
 		 605 aa  324  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  32.89 
 
 		 601 aa  323  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  35.32 
 
 		 579 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 623 aa  323  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.59 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>