More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2017 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 322 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  51.86 
 
 		 321 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 477 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 528 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  39.44 
 
 		 235 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 237 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.02 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.67 
 
 		 2401 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.09 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.34 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.6 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.12 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1268 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  29.79 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  28.72 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.92 
 
 		 253 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.72 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0241  hypothetical protein  26.14 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.14 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 672 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  29.52 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.11 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  24.77 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  24.77 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  27.06 
 
 		 470 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  41.41 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 470 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2760  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.58 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0289514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2743  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.58 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 924 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 1077 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  27 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  23.25 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>