More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0070 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  79.52 
 
 		 210 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  78.57 
 
 		 210 aa  340  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  78.1 
 
 		 210 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  77.62 
 
 		 210 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  67.46 
 
 		 210 aa  304  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  67.62 
 
 		 210 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  68.1 
 
 		 210 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  64.11 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  67.31 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  66.35 
 
 		 211 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  37.11 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  44.29 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  41.29 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  43.57 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  33.64 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 191 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  37.06 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  41.96 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  38.12 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  41.26 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  37.72 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  30.69 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  40.4 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  36.61 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  41.43 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.11 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  39.24 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  35.52 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  35.52 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  35.52 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  35.52 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  36.31 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.04 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  37.04 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.17 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  35.52 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  37.5 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.42 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  37.87 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  40.51 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  41.61 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  31.46 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  44.27 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  36.97 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  35.57 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  37.06 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  43.2 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 		 296 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  35.57 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  40.44 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  36.36 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
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