74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3687 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  87.26 
 
 
212 aa  357  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  87.26 
 
 
212 aa  357  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  87.26 
 
 
212 aa  357  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  73.11 
 
 
212 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  67.92 
 
 
212 aa  292  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  66.04 
 
 
212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  50.23 
 
 
213 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  47.22 
 
 
212 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  48.58 
 
 
219 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  47.22 
 
 
212 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  47.22 
 
 
233 aa  197  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  50.46 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  46.76 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  40.47 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  40.53 
 
 
346 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  40.53 
 
 
346 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  40.53 
 
 
346 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  38.97 
 
 
346 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  38.29 
 
 
352 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  39.38 
 
 
350 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  39.31 
 
 
343 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  31.35 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  31.02 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  31.67 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  36.89 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  36.89 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.89 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  36.89 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  36.89 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.89 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  36.89 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
1204 aa  85.5  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.07 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  31.79 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  36.07 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  28.79 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  35.9 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  38.33 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  31.46 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  35.2 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  28.11 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  25.85 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  30.83 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  28.77 
 
 
272 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  31.67 
 
 
412 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  34.15 
 
 
418 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  30.63 
 
 
573 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  31.3 
 
 
744 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 
546 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  31.93 
 
 
412 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.25 
 
 
418 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  37.08 
 
 
421 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  32.52 
 
 
418 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  32.52 
 
 
418 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  35.56 
 
 
543 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
547 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30 
 
 
426 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.67 
 
 
600 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
380 aa  42  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 
418 aa  41.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 
425 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>