More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4117 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  42.92 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1350  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.76 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  31.48 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  33.33 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.64 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  38.78 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  39.32 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.27 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 337 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  39.25 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  30.95 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  43 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.45 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.7 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0563  methyltransferase domain protein  52.27 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000931916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  36.36 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  38 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  35.77 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.88 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  33.68 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.62 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  33.58 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  30.3 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  40.83 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.57 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  41.56 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  34.69 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  40.21 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.84 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  30.53 
 
 		 2112 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.27 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4887  methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  38.74 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  30.4 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  34.46 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  35.05 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 354 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.89 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.91 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  32.88 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.39 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  40.51 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  35.14 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.27 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2368  methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>