More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3963 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  100 
 
 		 355 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2095  cysteine desulfurase  68.06 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00656129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0442  putative aminotransferase  67.76 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0429876  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2363  cysteine desulfurase  67.46 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1632  cysteine desulfurase  63.32 
 
 		 348 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.422734  hitchhiker  0.00000261738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  62.43 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2365  aminotransferase, class V  62.06 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  42.31 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  47.23 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.07 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  41.53 
 
 		 1143 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  43.87 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  46.35 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  36.46 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  42.47 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.96 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  34.3 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  40.11 
 
 		 1139 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  42.37 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  45.43 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  36.8 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  34.04 
 
 		 384 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  43.05 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  40.42 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  44.88 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  34.85 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  39.13 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  41.67 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  38.69 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.57 
 
 		 388 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  36.05 
 
 		 402 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  42.59 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  41.33 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  36.71 
 
 		 392 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  36.31 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  41.19 
 
 		 391 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.18 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  44.93 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  40.44 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  35.81 
 
 		 398 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  35.54 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  36.14 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  37.86 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  34.38 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  34.73 
 
 		 398 aa  205  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  43.42 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  47.67 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  41.6 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.26 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  41.6 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  41.24 
 
 		 389 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  40.52 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  35.98 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  37.22 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  34.84 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  33.42 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  34.54 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  37.4 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 1135 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 381 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  33.96 
 
 		 401 aa  195  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  41.97 
 
 		 391 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  41.94 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  35.56 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  32.63 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  40.7 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  40.91 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  32.03 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.21 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  36.15 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  37.86 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  31.77 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  33.98 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  33.7 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  36.87 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  35.54 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  37.53 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  31.68 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  32.15 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  36.29 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  33.43 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>