More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2685 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 206 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.419854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2998  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.29 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.172994  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0913  enoyl-CoA hydratase  68.88 
 
 		 206 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.37 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.9 
 
 		 204 aa  215  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0406  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 		 203 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00846941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0067  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.13 
 
 		 248 aa  206  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 		 263 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.77 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.01 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.32 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.23 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.05 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.53 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0813  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.57 
 
 		 692 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 260 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3592  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.37 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.33 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.89 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.2 
 
 		 661 aa  104  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.26 
 
 		 259 aa  104  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 260 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 		 262 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.64 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.94 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 259 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.95 
 
 		 258 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 260 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  38.3 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.08 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.55 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 254 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.7 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.08 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 267 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.17 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  36.31 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 		 259 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 265 aa  99  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 		 259 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.8 
 
 		 662 aa  99  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  37.43 
 
 		 264 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 		 260 aa  98.6  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 		 258 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 259 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 		 264 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 		 260 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.81 
 
 		 729 aa  98.2  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.88 
 
 		 257 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 		 260 aa  98.2  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.48 
 
 		 262 aa  98.2  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 		 262 aa  97.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 265 aa  97.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 		 261 aa  97.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 		 261 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 		 263 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.65 
 
 		 258 aa  97.1  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 		 263 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 265 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 		 260 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  35.05 
 
 		 285 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 261 aa  97.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  35.05 
 
 		 285 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  36.27 
 
 		 263 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.67 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3949  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.27 
 
 		 729 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.706953  normal  0.0634882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>