More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1643 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  83.41 
 
 		 462 aa  740    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 463 aa  941    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  66.52 
 
 		 466 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  67.56 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  66.52 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  63.7 
 
 		 479 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  58.35 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  60.18 
 
 		 471 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  59.96 
 
 		 471 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  61.2 
 
 		 472 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  58.81 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  60.75 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  59.96 
 
 		 473 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  59.42 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  56.59 
 
 		 499 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  55.08 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  41.41 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 442 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  34.73 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 423 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.8 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.57 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.57 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.57 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.57 
 
 		 426 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.57 
 
 		 426 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 426 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.38 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.35 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.69 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.45 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.88 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.06 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  32.91 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 425 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  29.93 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.32 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  28.89 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  29.86 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  32.91 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.79 
 
 		 427 aa  157  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 424 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 431 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.56 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  32.59 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  30.45 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>