237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0261 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0261  putative competence protein F  100 
 
 		 174 aa  361  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  90.17 
 
 		 280 aa  324  3e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2025  amidophosphoribosyltransferase-like protein  50.89 
 
 		 238 aa  151  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0568968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 247 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  32.61 
 
 		 262 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  34.12 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.69 
 
 		 244 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  34.25 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  35.14 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.82 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  31.13 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  33.56 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  32.64 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  35.71 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  30.19 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  33.78 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  33.58 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  31.08 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  31.76 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  31.08 
 
 		 263 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  34.06 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  30.41 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  38.54 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  34.07 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  38.54 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  34.31 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  32.21 
 
 		 227 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  27.04 
 
 		 219 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  32.35 
 
 		 268 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.93 
 
 		 233 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  30.41 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  35.05 
 
 		 293 aa  61.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.08 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  30.37 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  33.56 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  34.67 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  32.19 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  30.99 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  36.46 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  31.62 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  37.89 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  30.87 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.03 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  33.65 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.34 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  32.43 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  40.22 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  33.57 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  27.69 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  36.63 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.94 
 
 		 256 aa  57.8  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 259 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  34.74 
 
 		 240 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  34.95 
 
 		 255 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 247 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  35.92 
 
 		 262 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  34.09 
 
 		 252 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  37.5 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  34.95 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.77 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.48 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.69 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  37.11 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  37.11 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.46 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  33.96 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  28.06 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  29.14 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  36.78 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  30.72 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  36.46 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.46 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  31.48 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  35.05 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  31.13 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>