118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1389 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1389  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1498  rhodanese-like domain-containing protein  36.11 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1790  rhodanese-like protein  35.87 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.40353 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  35.09 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0351  hypothetical protein  38.1 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000374621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2162  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236799  normal  0.0673229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6117  hypothetical protein  35.78 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0701  rhodanese domain protein, putative  35.71 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  36.54 
 
 
254 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  33.65 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2515  rhodanese domain-containing protein  30.7 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00513987  normal  0.508623 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1940  hypothetical protein  37.11 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000119767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  37.36 
 
 
251 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0470  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1537  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655026  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.31 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  30.48 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  29.7 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
170 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2421  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  30 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0702  hypothetical protein  32.22 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  30 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  39.06 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0512  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00637526  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  25.95 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3765  rhodanese-like protein  28.87 
 
 
150 aa  43.5  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0703444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  47.62 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  29.79 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  29.79 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
476 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  29.29 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  33.71 
 
 
711 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  42 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.91 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 
119 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
466 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  30.77 
 
 
109 aa  42  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  32.29 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  40 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.28 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  28.89 
 
 
146 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27 
 
 
392 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  28.09 
 
 
125 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  30.95 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
149 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  25.42 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  25 
 
 
222 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  27.06 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  31.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  35.63 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  31.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  24.41 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 
121 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  25.41 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  39.02 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  30.69 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  25.41 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  30.39 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  30.69 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  30.69 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29 
 
 
390 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  28.92 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  29.76 
 
 
356 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
329 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>