126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3765 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3765  rhodanese-like protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0703444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3646  Rhodanese domain protein  69.33 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  60.54 
 
 		 209 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2446  rhodanese-like protein  59.73 
 
 		 171 aa  176  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000105937  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2616  Rhodanese domain protein  50.66 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00605824  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1482  hypothetical protein  51.32 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1520  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000699946  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2063  rhodanese-like protein  51.66 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5459  rhodanese-like protein  49.34 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2059  rhodanese-like protein  50.99 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5927  rhodanese-like protein  48.68 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2150  rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2168  rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2060  rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 		 154 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2187  rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.992479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1121  rhodanese domain-containing protein  50.66 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461947 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1744  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2771  rhodanese-like protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1843  rhodanese-like domain-containing protein  49.34 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2254  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3066  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2636  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2692  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.340906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1525  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  57.36 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  44.68 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1085  Rhodanese domain protein  58.33 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1177  Rhodanese domain protein  58.33 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1257  hypothetical protein  58.09 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.737183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  52.34 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  53.91 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  52.71 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  52.71 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20970  Rhodanese-like protein  48.97 
 
 		 174 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00660232  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  52.71 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  51.16 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  52.71 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4035  Rhodanese domain protein  48.18 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  51.56 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2139  rhodanese-like protein  44.59 
 
 		 176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109425  decreased coverage  0.0000830085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0535  Rhodanese domain protein  51.47 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  46.15 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  48.94 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0366  rhodanese-like domain-containing protein  46.15 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1909  rhodanese/Cdc25 fold  46.15 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.636231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1822  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0002  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108771  hitchhiker  1.00132e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0687  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0929  rhodanese-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0452  rhodanese-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0195  rhodanese-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  46.09 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  45.04 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  45.04 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1556  hypothetical protein  46.56 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0512  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00637526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1490  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  42.86 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3372  rhodanese-related sulfurtransferase  41.84 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2946  Rhodanese domain protein  48.55 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1890  Rhodanese domain protein  41.83 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  42.96 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  41.09 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  39.85 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  38.71 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0220  rhodanese domain-containing protein  52.55 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0235  rhodanese-like protein  38.58 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.661399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35020  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.72 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2535  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.607232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0525  rhodanese-like protein  52.55 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0537  rhodanese domain-containing protein  52.55 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0661648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0515  rhodanese domain-containing protein  52.55 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3477  Rhodanese domain protein  48.55 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0171  rhodanese-like protein  37.4 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  40.48 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3119  Rhodanese domain protein  44.2 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3859  rhodanese domain-containing protein  46.27 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0048  rhodanese-like protein  39.53 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3644  Rhodanese domain protein  47.41 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 151 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0157  Rhodanese domain protein  39.68 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0150  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2392  Rhodanese domain protein  48.89 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0296  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3127  hypothetical protein  34.93 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2329  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2496  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0955  rhodanese-like protein  31.47 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0394414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3551  hypothetical protein  34.68 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1529  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155027  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  29.57 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.15 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  27.45 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  29.6 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>