167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1369 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  978    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  56.19 
 
 
409 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  50.46 
 
 
433 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 
343 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
350 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
373 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 
371 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 
380 aa  126  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
371 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  32.37 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  32.97 
 
 
441 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 
353 aa  118  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
353 aa  117  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  29.29 
 
 
337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  28.71 
 
 
348 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 
344 aa  110  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 
331 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 
341 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 
332 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 
346 aa  107  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
343 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  27.7 
 
 
457 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 
331 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 
440 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  25.77 
 
 
417 aa  94  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 
298 aa  90.9  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 
300 aa  87  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  26.09 
 
 
334 aa  87  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 
375 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  24.72 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.19 
 
 
338 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 
287 aa  57  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.96 
 
 
326 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  29.87 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.06 
 
 
322 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.57 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  30.28 
 
 
333 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  34.51 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  30.4 
 
 
330 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  28.02 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
287 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.73 
 
 
333 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2292  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1436  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.7 
 
 
326 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.93 
 
 
315 aa  50.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 
343 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.15 
 
 
356 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.67 
 
 
359 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 
320 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 
320 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 
355 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.39 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  30.77 
 
 
206 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
290 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
491 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.11 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  30.95 
 
 
491 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.09 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
491 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
491 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
491 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
491 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.45 
 
 
321 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.7 
 
 
326 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.63 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 
298 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.46 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
351 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.46 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.25 
 
 
353 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.91 
 
 
332 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 
265 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.53 
 
 
384 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
323 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 
491 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.26 
 
 
327 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2276  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
396 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.91 
 
 
388 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.35 
 
 
376 aa  47  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2343  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.98 
 
 
383 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.06 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.3 
 
 
329 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.09 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4885  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.73 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.56 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.86 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.18 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.19 
 
 
325 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.45 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.82 
 
 
329 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>