276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0239 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 171 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 177 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  41.57 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  41.43 
 
 		 217 aa  117  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  41.38 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  41.38 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  41.38 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  34.32 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  34.54 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  34.32 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  31.4 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  36.31 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  34.54 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  39.75 
 
 		 285 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.37 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  39.44 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  34.32 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  36.05 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  38.73 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  34.97 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 223 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 244 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  32.58 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  32.58 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  34.88 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 221 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1470  hypothetical protein  34.27 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  31.36 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1513  hypothetical protein  32.47 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 242 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 239 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  35.33 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  35.33 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>