More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1902 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 457 aa  916    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  79.61 
 
 		 457 aa  749    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  76.59 
 
 		 458 aa  728    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.47 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.11 
 
 		 481 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.97 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.79 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.35 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.3 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.78 
 
 		 474 aa  177  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.49 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 		 473 aa  170  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.16 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.78 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.59 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.64 
 
 		 503 aa  156  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 		 542 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  28.44 
 
 		 477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.52 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.78 
 
 		 523 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  28.19 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.75 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.41 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 		 483 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.77 
 
 		 505 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.17 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.61 
 
 		 552 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.57 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.56 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.51 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.03 
 
 		 463 aa  147  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.73 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  28.44 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.06 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.72 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.79 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  28.44 
 
 		 480 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.97 
 
 		 504 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.6 
 
 		 478 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.58 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  28.9 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  29.91 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.76 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  28.25 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.82 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.74 
 
 		 477 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.15 
 
 		 528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.96 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  27.59 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.8 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  28.93 
 
 		 513 aa  139  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.16 
 
 		 460 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  29.42 
 
 		 480 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  32.4 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  32.4 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  32.4 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  32.4 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  32.4 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  32.4 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  32.4 
 
 		 477 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.01 
 
 		 486 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  28.03 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.07 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  27.96 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.38 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.85 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  36.63 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  28.94 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.83 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  29.31 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 		 546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0100  microcin-processing peptidase 2  27.19 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.884188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 		 479 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.02 
 
 		 480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 		 479 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.74 
 
 		 479 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.34 
 
 		 478 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.33 
 
 		 480 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.97 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.65 
 
 		 481 aa  136  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  37.04 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  29.44 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  27.85 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  32.48 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  33.46 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.9 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  28.85 
 
 		 486 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  27.37 
 
 		 486 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>