More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1376 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1376  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.585968 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0262  ABC transporter related  68.88 
 
 		 243 aa  346  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.888002 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0287  ABC transporter related  69.71 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1288  ABC transporter related  68.46 
 
 		 253 aa  339  2e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  41.05 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  39.83 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  37.23 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  41.05 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  36.18 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  33.91 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  35.22 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  35.22 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  34.96 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  38.66 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  35.62 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  36.52 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.96 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  37.13 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  34.48 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  36.02 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.63 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.4 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  38.35 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  38.35 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  39.84 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  37.22 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  37.22 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  37.22 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  37.59 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  34.05 
 
 		 273 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.36 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  34.87 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  38.1 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  35.17 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  35.06 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  38.27 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0122  ABC transporter related  36.89 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.102502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  30.57 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  36.99 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  35.91 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  36.05 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.44 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.83 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  36.32 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.33 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  36.52 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  38.43 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  35.02 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  36.29 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.36 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  36.47 
 
 		 295 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  34.96 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  34.04 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  36.48 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  32.18 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  34.96 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  33.48 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  37.66 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  38.29 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  37.1 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  35.32 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  35.18 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  36.49 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  32.18 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  36.65 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  40.3 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  36.17 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.24 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  39.44 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  36.29 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>