More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1025 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  79.83 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  80.69 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  78.63 
 
 		 234 aa  391  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  44.73 
 
 		 237 aa  223  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  40.97 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  38.33 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  39.01 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  32.39 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  28.85 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  28.96 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  30.32 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  32.08 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  31.51 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  30.89 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  30.74 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  28.29 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  30.97 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.46 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  30.97 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  28.92 
 
 		 263 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 462 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  32.88 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  28.17 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  33.67 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  31.31 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  30.91 
 
 		 457 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  28.17 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  27.49 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  30.49 
 
 		 458 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.79 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  25.79 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  27.78 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  27.49 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  28.64 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  30.54 
 
 		 271 aa  85.9  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.24 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  31.51 
 
 		 287 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  31.51 
 
 		 260 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  29.76 
 
 		 257 aa  85.1  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.74 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.74 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.74 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  28.96 
 
 		 464 aa  85.1  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.74 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  30.59 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  31.51 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  31.51 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  27.56 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  31.53 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  25.3 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  28.7 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  27.89 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  31.82 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  31.82 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  32.66 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  27.27 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  31.05 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  30.32 
 
 		 606 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  27.95 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  28.35 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  27.98 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  25.58 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  27.31 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  31.51 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  27.95 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  27.95 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  26.64 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  28.85 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  27.83 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  26.36 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  30.26 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  28.16 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  29.85 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  31.5 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  27.17 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  27.78 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  28.85 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  27.02 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  27.17 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  31.66 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  32.99 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  25.68 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  29.91 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  28.25 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  29.47 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  26.56 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  29.25 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  32.99 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  26.23 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>