More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0246 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0246  aminotransferase, class V  100 
 
 		 381 aa  751    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.44 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  30.99 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  27.72 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  28.72 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  27.66 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.01 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.84 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  27.68 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.65 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.29 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.85 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  33.87 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.51 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  24.94 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  25.8 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  27.61 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  27.02 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  27.62 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  27.5 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  21.72 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.42 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  33.53 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.8 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  25 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.31 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.71 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  27.9 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  25.22 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  28.9 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  25.22 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  31.58 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  23.57 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  23.69 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  26.12 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.85 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9107  kynureninase  32.74 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  30.16 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  23.44 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.33 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  31.36 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.41 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  31.03 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  27.48 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  33.52 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  25.29 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  26.79 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  32.95 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  28.24 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  30.05 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  29.5 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  29.5 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  23.53 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  29.44 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  31 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  29.73 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  25.64 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.31 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  24.7 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  25.91 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25.64 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  30.23 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  24.43 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.27 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24.31 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  28.25 
 
 		 661 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  29.07 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  25.3 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  26.09 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.69 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  28.1 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  33.52 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  30.39 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  28.32 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  31.19 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.96 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  28.74 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  24.26 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  31.25 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  22.61 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  22.47 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.51 
 
 		 445 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  19.21 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  22.91 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  32.22 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  28.62 
 
 		 347 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  29.15 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  26.48 
 
 		 688 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  25.29 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  32.34 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  25.94 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  29.31 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  27.11 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0698  aminotransferase, class V  35.8 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>