125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3685 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  100 
 
 		 527 aa  1107    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  51.46 
 
 		 524 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  47.43 
 
 		 537 aa  535  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  50.39 
 
 		 526 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  49.41 
 
 		 514 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  48.63 
 
 		 514 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  48.82 
 
 		 522 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  49.6 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  49.22 
 
 		 517 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  48.92 
 
 		 524 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  46.08 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  45.51 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  45.19 
 
 		 517 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  44.34 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  45.31 
 
 		 518 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  43.86 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  44.42 
 
 		 543 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  44.23 
 
 		 543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  44.06 
 
 		 525 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  45.19 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  45.01 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  43.27 
 
 		 531 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  41.24 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  41.24 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  41.35 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  42.94 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  41.34 
 
 		 524 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  43.37 
 
 		 532 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  42.35 
 
 		 520 aa  412  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  41.5 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  42.83 
 
 		 522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  42.26 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  42.06 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  40.79 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  41.67 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  40.95 
 
 		 508 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  39.44 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  39.65 
 
 		 507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  37.43 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  37.3 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  37.05 
 
 		 511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  36.4 
 
 		 537 aa  330  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  35.91 
 
 		 492 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.06 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.04 
 
 		 498 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  34.79 
 
 		 507 aa  256  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  34.12 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  34.58 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  35.65 
 
 		 506 aa  253  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  36.26 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  34 
 
 		 501 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  36.13 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  35.97 
 
 		 501 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  33.98 
 
 		 509 aa  246  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  34.16 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.6 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  34.38 
 
 		 523 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  33.46 
 
 		 503 aa  243  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  35.73 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  35.07 
 
 		 507 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.13 
 
 		 529 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.58 
 
 		 499 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  30.1 
 
 		 538 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 505 aa  239  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  30.48 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  30.48 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  33.65 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  30.48 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  30.93 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.33 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  34.89 
 
 		 501 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  30.48 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.18 
 
 		 497 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  30.48 
 
 		 538 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.26 
 
 		 508 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 499 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31.98 
 
 		 505 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.98 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  35.34 
 
 		 506 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 503 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.07 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  32.76 
 
 		 503 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.25 
 
 		 509 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.1 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  33.66 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  32.57 
 
 		 501 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  35.04 
 
 		 515 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  31.74 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 494 aa  230  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  34.92 
 
 		 512 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>