299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2766 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2766  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 312 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  31.6 
 
 		 556 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2755  hypothetical protein  25.55 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0392069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  28.99 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  28.26 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.36 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.15 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.09 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  25.13 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  23.04 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.36 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  27.84 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  25.37 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  26.37 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 562 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  23.37 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  24.61 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  27.07 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  24.63 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  25.84 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  26.7 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  23.08 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  26.81 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  23.08 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  47.27 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  32.23 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  23.08 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.03 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.35 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.11 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  25.79 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  22.22 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>