223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0776 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  100 
 
 
187 aa  386  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  73.26 
 
 
187 aa  305  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  71.12 
 
 
187 aa  294  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  69.52 
 
 
187 aa  286  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  68.45 
 
 
187 aa  285  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  68.45 
 
 
188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  65.78 
 
 
189 aa  275  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  39.78 
 
 
184 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  39.23 
 
 
186 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  36.67 
 
 
186 aa  150  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  40.86 
 
 
183 aa  150  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  36.26 
 
 
187 aa  148  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  36.96 
 
 
209 aa  144  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  35.16 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  37.57 
 
 
190 aa  122  3e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  36.6 
 
 
191 aa  117  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  34.97 
 
 
208 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  34.59 
 
 
198 aa  111  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  32.29 
 
 
193 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  34.12 
 
 
186 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  33.5 
 
 
192 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  36.69 
 
 
188 aa  102  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  30.11 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  32.4 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  31.52 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  31.98 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  30.21 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  33.91 
 
 
198 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  33.13 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  33.13 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  33.13 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  30.91 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  34.07 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  30.91 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  32.48 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  33.13 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.25 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  30.56 
 
 
146 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  32.72 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  30.85 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  32.72 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  31.46 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  29.89 
 
 
184 aa  91.3  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  32.3 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  31.61 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  30.38 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  31.18 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  31.43 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  31.43 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  34.42 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  31.33 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  30.72 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  30.86 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  34.08 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  31.18 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  29.24 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  31.43 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  31.15 
 
 
191 aa  89  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  30.68 
 
 
193 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  30.43 
 
 
187 aa  89  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  29.65 
 
 
187 aa  89  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  31.03 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  36.69 
 
 
288 aa  88.2  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  29.19 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  29.19 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  29.19 
 
 
200 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  30.81 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  29.19 
 
 
200 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  30 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  29.07 
 
 
190 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  26.7 
 
 
186 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  32.61 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  29.55 
 
 
184 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  32.97 
 
 
196 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48166  predicted protein  32.76 
 
 
393 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  28.9 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  29.34 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  31.05 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  29.27 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  27.98 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  29.32 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  27.27 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  29.09 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  28.75 
 
 
190 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  28.39 
 
 
197 aa  84.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  30.53 
 
 
196 aa  84.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  27.11 
 
 
187 aa  84.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  27.98 
 
 
187 aa  84.3  9e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  30.06 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>