More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04837 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04837  outer membrane channel protein  100 
 
 
477 aa  936    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3083  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.68 
 
 
490 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536231  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  38.03 
 
 
516 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  38.03 
 
 
516 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  38.03 
 
 
513 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1462  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.54 
 
 
480 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0250838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  38.03 
 
 
513 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5856  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.51 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  39.34 
 
 
468 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.2 
 
 
467 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.63 
 
 
544 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  38.06 
 
 
467 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.75 
 
 
480 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.29 
 
 
496 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.68 
 
 
492 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
476 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
476 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.19 
 
 
476 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.95 
 
 
485 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  33.54 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  33.54 
 
 
461 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.85 
 
 
457 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.85 
 
 
457 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  36.65 
 
 
457 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.44 
 
 
457 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  36.65 
 
 
457 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.44 
 
 
460 aa  219  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.36 
 
 
486 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.36 
 
 
486 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.44 
 
 
460 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.68 
 
 
460 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.61 
 
 
475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.27 
 
 
505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36 
 
 
480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.17 
 
 
470 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  35.9 
 
 
499 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.11 
 
 
483 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.14 
 
 
489 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.34 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.42 
 
 
469 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.61 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.54 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.31 
 
 
500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.63 
 
 
499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.4 
 
 
469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.79 
 
 
525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.69 
 
 
528 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  36.75 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.41 
 
 
514 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.5 
 
 
528 aa  213  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.82 
 
 
462 aa  213  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.84 
 
 
514 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.7 
 
 
495 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
487 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.52 
 
 
491 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.34 
 
 
472 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  37.68 
 
 
475 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36 
 
 
501 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.73 
 
 
515 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3425  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  33.88 
 
 
461 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.55 
 
 
485 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.67 
 
 
467 aa  206  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  36.09 
 
 
514 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.24 
 
 
516 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.03 
 
 
472 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.02 
 
 
476 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 
503 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 
475 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.23 
 
 
475 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0311  outer membrane CHANEL lipoprotein  38.83 
 
 
476 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.11877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.68 
 
 
477 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.93 
 
 
475 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.77 
 
 
510 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.82 
 
 
507 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.6 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60820  outer membrane protein OprJ  37.24 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.88 
 
 
480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.36 
 
 
469 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.05 
 
 
489 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.26 
 
 
507 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.39 
 
 
486 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.84 
 
 
507 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.26 
 
 
507 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.75 
 
 
493 aa  199  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  37.3 
 
 
553 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.45 
 
 
507 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  37.39 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.3 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  33.33 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  37.39 
 
 
514 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  37.39 
 
 
514 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.39 
 
 
551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.3 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  37.39 
 
 
514 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  37.3 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  37.39 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  37.3 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  34.24 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>