68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04291 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  100 
 
 		 319 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.59 
 
 		 284 aa  322  6e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.98 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.26 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.66 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.92 
 
 		 256 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.78 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.05 
 
 		 280 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.88 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.85 
 
 		 291 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.84 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.85 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.12 
 
 		 262 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.82 
 
 		 271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 		 260 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.96 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.87 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.86 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.45 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.81 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.96 
 
 		 269 aa  99  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  29.83 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  32.05 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 		 621 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  25.45 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  42.31 
 
 		 160 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.54 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  23.59 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  26.22 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  27.72 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 		 837 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  27.82 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.77 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.95 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1839  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 571 aa  49.3  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  29.46 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  29.46 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.15 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.87 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.61 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0998  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.18 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0392935  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37824  predicted protein  30.61 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.25 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.82 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.74 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  25.82 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.04 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  34.12 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 		 242 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>