253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01510 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  100 
 
 
420 aa  843    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  69.65 
 
 
415 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  58.21 
 
 
425 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  58.21 
 
 
424 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  59.33 
 
 
419 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  54.85 
 
 
422 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  54.66 
 
 
424 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  54.85 
 
 
422 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  57.07 
 
 
421 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  55.28 
 
 
422 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  56.5 
 
 
424 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  57.44 
 
 
412 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  54.63 
 
 
412 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  54.63 
 
 
412 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  55.97 
 
 
402 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  56.25 
 
 
413 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  52.56 
 
 
458 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  53.86 
 
 
425 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  52.89 
 
 
447 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  50.67 
 
 
452 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  51.48 
 
 
458 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  52.7 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  50.44 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  54.06 
 
 
421 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  56.21 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  52.89 
 
 
447 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  56.01 
 
 
391 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  50.79 
 
 
482 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  53.52 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  49.63 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  55.61 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  53.45 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  55.58 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  56.47 
 
 
410 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  56.97 
 
 
413 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  52.59 
 
 
404 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  50 
 
 
402 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  49.75 
 
 
402 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  51.28 
 
 
390 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  49.39 
 
 
407 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  52.28 
 
 
458 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  49.14 
 
 
406 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  49.64 
 
 
407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  49.27 
 
 
416 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  48.89 
 
 
402 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  47.8 
 
 
411 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  47 
 
 
411 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  50.12 
 
 
419 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  47.91 
 
 
410 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  47.16 
 
 
414 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  45.99 
 
 
406 aa  338  8e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  47.78 
 
 
409 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  46.7 
 
 
409 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  49.63 
 
 
404 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  45.25 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  46.85 
 
 
395 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  47.51 
 
 
408 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  44.44 
 
 
428 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  44.6 
 
 
409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  46.58 
 
 
416 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  47.46 
 
 
414 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  45.68 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  46.37 
 
 
429 aa  302  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  46.87 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  45.59 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  45.57 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  45.34 
 
 
392 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  47.04 
 
 
405 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  36.25 
 
 
398 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  43.3 
 
 
397 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  44.74 
 
 
401 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.14 
 
 
430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  30.7 
 
 
419 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  29.37 
 
 
412 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.11 
 
 
403 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  26.68 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.5 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  30.36 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  28.13 
 
 
412 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  29.55 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  29.13 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  26.25 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  28.61 
 
 
408 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  25.47 
 
 
412 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.51 
 
 
414 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  26.44 
 
 
422 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  26.44 
 
 
422 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  25.53 
 
 
420 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.41 
 
 
406 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  26.34 
 
 
394 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  27.9 
 
 
426 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  26.88 
 
 
408 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  21.38 
 
 
404 aa  99.8  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  25.76 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  27.87 
 
 
415 aa  98.2  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  27.47 
 
 
457 aa  96.7  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  23.45 
 
 
455 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  26.23 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  26.03 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>