183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00215 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  59.49 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  59.49 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.72 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  53.69 
 
 
247 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  54.13 
 
 
252 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  51.23 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  51.64 
 
 
250 aa  261  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  57.81 
 
 
250 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  54.32 
 
 
248 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  52.85 
 
 
256 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  53.5 
 
 
248 aa  255  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  53.5 
 
 
248 aa  255  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  53.91 
 
 
248 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  53.91 
 
 
248 aa  255  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  54.73 
 
 
248 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  54.73 
 
 
248 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  54.73 
 
 
248 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  54.32 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  54.89 
 
 
247 aa  250  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  53.72 
 
 
248 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  54.47 
 
 
247 aa  248  6e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  56.12 
 
 
243 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  52.89 
 
 
248 aa  248  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  53.01 
 
 
245 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  54.55 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  53.09 
 
 
248 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  50.61 
 
 
248 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  49.17 
 
 
260 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  53.72 
 
 
248 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  51.23 
 
 
245 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  51.23 
 
 
245 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  51.23 
 
 
245 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  50.21 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.75 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  50 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.54 
 
 
251 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  47.92 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  47.3 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  49.79 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  49.79 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  49.79 
 
 
248 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  45.87 
 
 
252 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  49.79 
 
 
248 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  48.97 
 
 
248 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  49.79 
 
 
248 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  48.97 
 
 
248 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  46.06 
 
 
252 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  49.79 
 
 
248 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  48.97 
 
 
248 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  48.97 
 
 
248 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  48.73 
 
 
246 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  48.75 
 
 
255 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.03 
 
 
251 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  51.25 
 
 
245 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  48.75 
 
 
255 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.79 
 
 
248 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  48.33 
 
 
255 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  48.76 
 
 
271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  46.44 
 
 
251 aa  224  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  50.64 
 
 
251 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.39 
 
 
263 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4289  heme exporter protein CcmC  54.55 
 
 
248 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000743229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  50.64 
 
 
251 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  51.75 
 
 
259 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0213  heme exporter protein CcmC  52.89 
 
 
248 aa  222  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  45.61 
 
 
243 aa  222  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  49.59 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  49.58 
 
 
254 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  49.15 
 
 
267 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  48.54 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  49.57 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  48.89 
 
 
254 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  45.83 
 
 
265 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  51.44 
 
 
274 aa  209  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  48.94 
 
 
256 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.56 
 
 
243 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  47.88 
 
 
256 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  48.44 
 
 
244 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  46.67 
 
 
243 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  50.22 
 
 
254 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  47.09 
 
 
251 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  44.35 
 
 
248 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  48.03 
 
 
262 aa  205  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  49.57 
 
 
261 aa  204  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  48.03 
 
 
244 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  46.28 
 
 
247 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  42.92 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  45.69 
 
 
262 aa  199  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  45.69 
 
 
262 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  44.35 
 
 
260 aa  198  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>