More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4704 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  277  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  96.53 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  56.06 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  47.14 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  55.04 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  45.86 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  48.92 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  48.06 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  48.85 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  50.72 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  48.84 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  47.76 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  56.41 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  44.27 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  44.7 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  46.83 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  44.7 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 168 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  52.9 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  41.3 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  48.12 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  46.32 
 
 		 177 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  54.07 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  52.94 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  44.27 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  43.07 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  46.09 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  38.57 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  46.09 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  49.12 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  43.61 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  41.54 
 
 		 407 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  42.66 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.43 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  47.1 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 189 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2711  YjgF family translation initiation inhibitor  41.55 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  39.01 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.01 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  39.01 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  41.73 
 
 		 185 aa  96.7  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  42.74 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  41.73 
 
 		 185 aa  96.7  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>