More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4943 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  100 
 
 		 376 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  98.4 
 
 		 376 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  96.54 
 
 		 376 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  93.03 
 
 		 376 aa  699    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  76.88 
 
 		 376 aa  587  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  75.53 
 
 		 376 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  73.94 
 
 		 376 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  72.87 
 
 		 378 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  71.81 
 
 		 378 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  71.12 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  68.14 
 
 		 372 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  57.26 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0589  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  38.81 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.08 
 
 		 350 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  26.81 
 
 		 350 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.56 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 391 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.34 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  33.94 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  28.67 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 385 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 419 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  37.01 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  27.62 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  34.08 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.59 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  29.45 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  44.37 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 309 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  26.76 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.92 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 		 363 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  41.14 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 410 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 363 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.9 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  26.33 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.29 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  34.78 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.37 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  27.94 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.73 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.73 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.73 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.37 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  25.37 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>