74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2170 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  99.02 
 
 		 102 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  61.86 
 
 		 104 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  57.14 
 
 		 109 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  47.06 
 
 		 475 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  43.75 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  43.75 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  44.05 
 
 		 117 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1764  hypothetical protein  84.09 
 
 		 74 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  43.9 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  39.36 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  41.46 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  40.21 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  34.12 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  34.12 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  36.47 
 
 		 100 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  40.48 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  35.23 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  47.62 
 
 		 93 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  40.7 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  32.63 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  39.02 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  38.14 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  37.78 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  45.05 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  39.51 
 
 		 116 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  36.05 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  35.16 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  34.12 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  37.65 
 
 		 101 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  32.26 
 
 		 102 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32680  hypothetical protein  75.76 
 
 		 36 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  53.33 
 
 		 380 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  38.64 
 
 		 106 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  51.11 
 
 		 368 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  33.33 
 
 		 108 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  32.47 
 
 		 136 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1234  putative integrase/recombinase  48.89 
 
 		 103 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  0.825212 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  31.17 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 358 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  34.94 
 
 		 397 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.71 
 
 		 358 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  51.11 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1173  putative integrase/recombinase  46.67 
 
 		 103 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  36 
 
 		 108 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  42.22 
 
 		 362 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 372 aa  45.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.18 
 
 		 413 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  33.33 
 
 		 96 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 384 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  33.33 
 
 		 96 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  31.58 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  41.3 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  33.33 
 
 		 94 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  41.3 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  41.3 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.49 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  43.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  33.78 
 
 		 356 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  40.68 
 
 		 91 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  35.71 
 
 		 402 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 354 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 358 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  34.12 
 
 		 399 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  34.21 
 
 		 384 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.9 
 
 		 360 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.21 
 
 		 365 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  35.56 
 
 		 355 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  27.03 
 
 		 367 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>