More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1786 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  100 
 
 		 1147 aa  2383    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 1303 aa  532  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 		 1220 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 1301 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  41.05 
 
 		 1239 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  39.82 
 
 		 1292 aa  505  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 		 1271 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 		 1265 aa  499  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  53.44 
 
 		 404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  53.44 
 
 		 404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 		 740 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 		 740 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  31.41 
 
 		 1608 aa  332  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 924 aa  280  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.51 
 
 		 1867 aa  269  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 		 828 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7833  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 732 aa  119  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 		 1476 aa  101  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 384 aa  91.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 441 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 673 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 953 aa  86.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.32 
 
 		 2401 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 386 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 539 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 418 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 371 aa  71.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 		 1067 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1400  hypothetical protein  25.08 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 		 361 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.03 
 
 		 403 aa  67.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 403 aa  67.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  25.81 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  27.43 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 360 aa  64.3  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.04 
 
 		 397 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  31.03 
 
 		 371 aa  64.3  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 689 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 425 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 		 366 aa  62  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 424 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 414 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 		 354 aa  60.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.79 
 
 		 388 aa  60.1  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.29 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  22.36 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  30.91 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 417 aa  57.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 		 413 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 401 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 377 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3788  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 349 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 399 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  24.48 
 
 		 398 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  21.21 
 
 		 1400 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.39 
 
 		 379 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 377 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 355 aa  57  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 407 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 421 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 359 aa  57  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 		 436 aa  57  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 		 413 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  23.06 
 
 		 401 aa  56.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 352 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 416 aa  56.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  23.53 
 
 		 382 aa  55.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 355 aa  55.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 377 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.49 
 
 		 382 aa  55.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0922  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 365 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1918  UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  26.79 
 
 		 359 aa  55.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 412 aa  55.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 419 aa  55.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  21.56 
 
 		 445 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 412 aa  55.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 412 aa  55.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 356 aa  55.1  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 402 aa  55.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 352 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 390 aa  54.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 417 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 1035 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>