23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1400 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1400  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  727    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 828 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  25.08 
 
 		 1147 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 924 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  31.82 
 
 		 1608 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 673 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 		 1476 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2765  hypothetical protein  22.87 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 1220 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 1192 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  27.78 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 1188 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 1301 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 1265 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 1271 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 953 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  23.86 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 1239 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 1301 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>